La gente de Siam consideraba muy hermosos a los gatos pardos bruñidos y creía que protegían a sus compañeros humanos del mal. Los gatos de color marrón sólido (café propio) estuvieron entre los primeros felinos que llegaron a Inglaterra desde Siam (ahora Tailandia) a fines del siglo XIX. Los primeros registros describen a estos gatos como "siameses, con capas de castaño bruñido y ojos azul verdoso". ”Se cree que estas importaciones no eran todas del mismo tipo genético, sino que representan lo que hoy se llamaría birmano, siamés con punta chocolate, tonquinés (híbridos birmanos / siameses) y marrones habanos. Es difícil distinguir uno de otro a partir de meras descripciones. Los gatos marrones sólidos se exhibieron en Europa a fines del siglo XIX y principios del siglo XX. Un marrón se llevó el primer premio en un espectáculo en Inglaterra en 1888, lo que indica que, en ese momento, los colombófilos valoraban y atesoraban a los gatos marrones. En una exposición de gatos de 1928, el British Siamese Cat Club otorgó un premio especial al gato con "el mejor cuerpo de chocolate".
Los escritores de la época describieron a estos gatos como "siameses de color chocolate, es decir, del mismo color en todas partes". Poco después, sin embargo, los autobronceadores cayeron en desgracia. En 1930, el Club de gatos siameses anunció, "El club lamenta mucho no poder fomentar la cría de ningún siamés de ojos azules que no sea". En consecuencia, los gatos marrones sólidos que carecían de ojos azules fueron prohibidos de la competencia y desaparecieron de la fantasía de los gatos. Los autobronceadores regresaron a principios de la década de 1950 cuando un puñado de criadores ingleses decidieron que el café seguía siendo hermoso. Trabajando primero por separado y luego juntos, estos criadores estudiaron la herencia genética del chocolate y luego comenzaron un programa de cría, aparentemente usando siameses, shorthairs domésticos y Russian Blues. Los criadores se esforzaban por producir un gato de color sólido con el color chocolate de los siameses, en lugar del color sable de los birmanos. En ese momento en Inglaterra, las únicas razas extranjeras reconocidas además del siamés eran el abisinio y el azul ruso. En 1952 nació el primer gatito de chocolate sólido registrado en Inglaterra. Este gatito, Elmtower Bronze Idol, se convirtió en el gato base de la nueva raza. Bronze Idol se produjo mediante el apareamiento de un siamés de punto de sello que portaba el gen del chocolate con un gato negro sólido que también llevaba chocolate. El gato negro era la descendencia de un gato negro criado hasta un punto de foca siamés. Dado que la coloración del chocolate está gobernada por un gen recesivo, Bronze Idol tuvo que recibir el gen de ambos padres para expresar el rasgo.
En 1958, el Consejo de Gobierno de Cat Fancy aceptó la raza para el campeonato con el nombre de Chestnut Brown Foreign. Posteriormente, la raza pasó a llamarse Habana. Existen dos historias sobre el nombre de la raza. Uno afirma que La Habana recibió su nombre de una raza de conejos del mismo color. El otro sostiene que La Habana lleva el nombre del tabaco Habana porque tiene el color y la apariencia mate de un puro Habana. Los primeros Habanas llegaron a América a mediados de la década de 1950. La raza fue reconocida en 1959 con el nombre de Habana Brown, y en 1964 CFA le otorgó el estatus de campeonato Habana Brown. En 1974, el acervo genético se cerró en América del Norte, lo que muchos criadores sintieron que era demasiado temprano en el desarrollo de la raza, dado que la raza era, y sigue siendo, bastante rara. A principios de la década de 1990, el número de Habana Brown estaba disminuyendo y era necesario criar gatos estrechamente relacionados porque no había gatos no relacionados disponibles. Los criadores se preocuparon mucho por el futuro de La Habana como una raza viable y se pusieron en contacto con la Dra. Leslie Lyons Ph.D. en el Laboratorio de Genética Veterinaria de la Universidad de California, Davis por su ayuda en el desarrollo de un programa cruzado.
La Fundación Winn Feline, una organización sin fines de lucro que apoya estudios para mejorar la salud de los gatos, financió el proyecto para que el Laboratorio de Genética Veterinaria pudiera analizar la composición genética de Habana Brown. El estudio mostró que La Habana necesitaba cruces cruzados para mantener la salud y la diversidad de la raza. Los criadores solicitaron a CFA que abriera la raza al cruzamiento. En 1997, la CFA votó para permitirle al Habana Brown ciertos cruces limitados hasta la punta chocolate y la punta del sello siamés, ciertos colores de Oriental Shorthairs (los criadores prefieren el ébano sólido y el castaño sólido) y los shorthairs domésticos negros sólidos y azules sólidos no registrados. Los gatitos de un Habana Brown y un cruce permitido podrían luego emparejarse con un Habana Brown, momento en el que la descendencia se consideraba Habana Browns registrable y visible siempre que cumplieran con el estándar de color. Hasta la fecha, los criadores informan que el programa ha tenido éxito en ampliar el acervo genético y mantener la raza sana.